Центр является единственным в Казахстане и Средней Азии учреждением, предоставляющим все три аспекта реабилитации: медицинскую реабилитацию, психолого-педагогическую коррекцию и социальную адаптацию. Кроме того, Национальный центр детской реабилитации – единственный реабилитационный центр с 2014 года, аккредитованный международной комиссией по качеству и безопасности медицинских услуг JCI (США) и подтвердивший свой статус в 2017 и 2021 годах. Согласно этого стандарта, в Центре обеспечиваются высокая безопасность и качество медицинских услуг международного уровня.